Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms