Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFNP31947 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFNP31947 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFNP31947 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms