Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TSPOP30536 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms