Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms