Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLD1P28340 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLD1P28340 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms