Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT1P26358 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms