Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATP5A1P25705 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5A1P25705 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms