Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APCP25054 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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APCP25054 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
APCP25054 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APCP25054 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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APCP25054 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
APCP25054 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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