Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms