Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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