Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms