Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD53P19397 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD53P19397 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD53P19397 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms