Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMP1P11279 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms