Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms