Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI2P10070 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI2P10070 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI2P10070 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI2P10070 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GLI2P10070 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms