Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms