Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA4O75335 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA4O75335 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms