Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms