Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP9BO43861 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP9BO43861 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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