Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCO2O43819 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms