Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNMO15061 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms