Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3AO14802 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.9 ms