Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM38O00635 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM38O00635 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms