Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCER2I3L3R5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms