Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms