Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DXG7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DXG7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DXG7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DXG7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B4DXG7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B4DXG7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms