Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC4A6NH21 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms