Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC160A6NGH7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms