Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A4Q9Y6R1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A4Q9Y6R1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms