Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USH1CQ9Y6N9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USH1CQ9Y6N9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms