Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX10Q9Y5X0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms