Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHLDA3Q9Y5J5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHLDA3Q9Y5J5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms