Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H5

PCDHA9, Protocadherin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA9Q9Y5H5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHA9Q9Y5H5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA9Q9Y5H5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA9Q9Y5H5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms