Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FARP1Q9Y4F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARP1Q9Y4F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms