Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB1Q9Y478 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB1Q9Y478 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB1Q9Y478 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms