Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q8

TSC22D4, TSC22 domain family protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D4Q9Y3Q8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC22D4Q9Y3Q8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC22D4Q9Y3Q8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms