Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D4Q9Y2X8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D4Q9Y2X8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms