Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM2AQ9Y2K7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM2AQ9Y2K7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms