Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B3Q9UQQ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B3Q9UQQ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms