Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TNNQ9UQP3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNQ9UQP3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNQ9UQP3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms