Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN8AQ9UQD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN8AQ9UQD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms