Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETD1BQ9UPS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SETD1BQ9UPS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SETD1BQ9UPS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SETD1BQ9UPS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SETD1BQ9UPS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SETD1BQ9UPS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms