Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMG5Q9UPR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG5Q9UPR3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG5Q9UPR3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms