Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHF8Q9UPP1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PHF8Q9UPP1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PHF8Q9UPP1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHF8Q9UPP1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms