Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIMS3Q9UJD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMS3Q9UJD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMS3Q9UJD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms