Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH22Q9UJ99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms