Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CGNQ9P2M7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNQ9P2M7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms