Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR4Q9NYA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms