Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CWC25Q9NXE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CWC25Q9NXE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms