Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARPBPQ9NWS1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PARPBPQ9NWS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms